高档的高速离心机都采用了微电脑控制系统，这些控制系统不但能确保离心机安全的运行还能自动完成工作任务。现在很多离心机都有较好的人性化的控制系统．比如：转子识别功能，安全锁功能，故障提示功能，加速和减速曲线等等。除以上几点之外还要注意一些细节和必要的配件。离心机的主要部件是电机，电机分为带碳刷电机和无碳刷电机，前者已经淘汰，现在的离心机大多都是无碳刷电机，有的电机还带有刹车功能。
　　目前，高速离心机的转速已可达到28000~30000r/min。大部分离心机不带真空系统，操作类似于低于离心机，非常简便，而其功能足够强大，可替代一部分超速离心机，而超速离心机的操作复杂，维护既麻烦又昂贵。除处理量较小的微量离心机以外，高速离心机都配置冷冻系统，以抵消转子在高速旋转中产生的热量，确保生物样品在离心操作中不变性。高速冷冻离心机的使用温度一般在4~6℃，波动要求控制在±2℃。有的离心机带真空系统，它不同于超速离心机的高真空，是部分真空，真空度不高。其目的是减少转子在空气中摩擦生热，减少转子旋转噪声，也有利于减轻电机负荷，延长驱动系统的寿命。
　　高速离心机的主要指标是最高转速和最大转子容量。由于机械强度的原因，体积小的转子最高转速高，而大容量转子的最高转速则低。高速冷冻离心机最大容量转子一般为6×500ml，其最高转速一般为10000r/min，近年出现6×1000ml、约8000r/min，但其价格较贵。那些具有相对离心加速度100000g的高速离心机（尤其离心机提供垂直转子的话）可代替超速离心机的部分使用范围。当然离心时间相对超速离心机长一些。
　　高速离心机运转时使用制冷,由于空气的水分,在离心腔内结霜,停机后霜化为水。大部分国外的低速大容量离心机,没有排水孔,离心腔中水愈积愈多。此时,用户应自行拆下转子,清理积水。在重新安装转子时,一定要装好,避免出事故。离心机在设计与制造时,对转子的加工误差带来的不平衡,已作了动平衡试验的补救,但凡是高速离心机,都有其允许的装样不平衡量。离心机装样如果不平衡量较大的话，超出允许量,离心机虽然也可以运转,但这时产生的不平衡力以每分钟n次频率猛然冲击轴承及支架,离心机是受损伤的。因此,用户对那些昂贵的离心机,尽量找好平衡后离心,对离心机的寿命有好处。
　　高速离心机完成离心时，要等离心陀完全静止后，才能打开舱门；请尽快取出离心管，先观察离心管是否完全，以及沉淀的位置，快速把上清液倒出，小心不要把沉淀弄混浊。不管所要的是上清或沉淀，请取用干净的烧杯收集上清，以免有失误。倾倒上清要很小心，以免把沉淀一起倒出来；若不慎混在一起，就要重来一次。若高速离心机离心管有漏，要找出原因，并且立刻清理离心陀或离心舱。